Évaluation d’une méthode d’amplification isotherme médiée par boucle pour la détection rapide du virus respiratoire syncytial chez les enfants atteints d’une infection respiratoire aiguë | Biomedica (Bogota);39(2) : 415-426, Jan-Juin 2019. tab, graf | LILACS

SUMMARY

Résumé Introduction. Le virus respiratoire syncytial humain (VRSH) est la cause la plus fréquente d’infection aiguë des voies respiratoires inférieures chez les enfants de moins de cinq ans. Le développement de techniques moléculaires pour l’identifier est l’un des défis actuels dans le domaine de la recherche clinique. Objectif. Évaluer une méthode d’amplification isotherme pour la détection rapide du hRSV chez les enfants atteints d’une infection aiguë des voies respiratoires. Matériaux et méthodes. L’ARN viral a été extrait de 304 échantillons d’écouvillons nasaux chez des enfants présentant des symptômes d’infection respiratoire aiguë et vus au service des urgences de l’hôpital de la Universidad del Norte à Barranquilla entre avril 2016 et juillet 2017. Le test RT-LAMP (Reverse Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification) a été évalué par rapport à des techniques moléculaires telles que la réaction en chaîne par polymérase de la transcriptase inverse à emboîtement multiple (Reverse Transcription- Polymerase Chain Reaction), La RT-PCR, qui a été utilisée comme test standard, la PCR en temps réel (PCR quantitative, qPCR) et la RT-LAMP de la protéine L (L) pour la détection rapide du virus respiratoire syncytial (RSV) de sous-type A et de sous-type B. Résultats. Le test RT-LAMP (M) avait une sensibilité de 93,59 %, une spécificité de 92,92 % et une concordance de 0,83 ± 0,036 par rapport au test RT-PCR niché. L’indice kappa du RT-LAMP (M) était plus élevé, et les valeurs du RT-LAMP (L) et de la qPCR concordaient (0,75 ± 0,043 et 0,71 ± 0,045, respectivement). Conclusions. Ces résultats indiquent que le test RT-LAMP (M) peut être considéré comme un outil cliniquement utile pour la détection de l’AVRSh, puisque le temps nécessaire pour obtenir des résultats, ainsi que les coûts, sont plus faibles, et que sa performance est meilleure que celle des autres tests moléculaires évalués.

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